Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PnkdQ69ZP3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PnkdQ69ZP3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms