Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z37

Samd9l, Sterile alpha motif domain-containing protein 9-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd9lQ69Z37 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Samd9lQ69Z37 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Samd9lQ69Z37 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Samd9lQ69Z37 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Samd9lQ69Z37 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Samd9lQ69Z37 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Samd9lQ69Z37 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Samd9lQ69Z37 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Samd9lQ69Z37 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Samd9lQ69Z37 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Samd9lQ69Z37 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Samd9lQ69Z37 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Samd9lQ69Z37 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Samd9lQ69Z37 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Samd9lQ69Z37 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Samd9lQ69Z37 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Samd9lQ69Z37 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Samd9lQ69Z37 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Samd9lQ69Z37 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Samd9lQ69Z37 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Samd9lQ69Z37 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Samd9lQ69Z37 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Samd9lQ69Z37 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Samd9lQ69Z37 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Samd9lQ69Z37 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Samd9lQ69Z37 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Samd9lQ69Z37 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Samd9lQ69Z37 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Samd9lQ69Z37 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Samd9lQ69Z37 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Samd9lQ69Z37 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Samd9lQ69Z37 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
Samd9lQ69Z37 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Samd9lQ69Z37 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Samd9lQ69Z37 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Samd9lQ69Z37 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Samd9lQ69Z37 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms