Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sptbn2Q68FG2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sptbn2Q68FG2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms