Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab3ipQ68EF0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab3ipQ68EF0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms