Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja3Q64448 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja3Q64448 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms