Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh2Q64221 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nhlh2Q64221 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms