Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zfp248Q640N4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp248Q640N4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp248Q640N4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp248Q640N4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp248Q640N4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp248Q640N4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zfp248Q640N4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Zfp248Q640N4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Zfp248Q640N4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Zfp248Q640N4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Zfp248Q640N4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Zfp248Q640N4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zfp248Q640N4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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