Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tfe3Q64092 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfe3Q64092 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms