Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col4a5Q63ZW6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col4a5Q63ZW6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col4a5Q63ZW6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms