Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ift52Q62559 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ift52Q62559 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ift52Q62559 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ift52Q62559 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ift52Q62559 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ift52Q62559 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ift52Q62559 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ift52Q62559 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ift52Q62559 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ift52Q62559 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ift52Q62559 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ift52Q62559 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ift52Q62559 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ift52Q62559 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ift52Q62559 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ift52Q62559 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ift52Q62559 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ift52Q62559 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ift52Q62559 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ift52Q62559 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ift52Q62559 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms