Protein–RNA interactions for Protein: Q62457

Gm20917, (clone BALB8N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20917Q62457 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm20917Q62457 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms