Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sp4Q62445 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp4Q62445 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp4Q62445 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms