Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpd52Q62393 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpd52Q62393 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpd52Q62393 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpd52Q62393 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpd52Q62393 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpd52Q62393 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tpd52Q62393 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpd52Q62393 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpd52Q62393 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpd52Q62393 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpd52Q62393 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpd52Q62393 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpd52Q62393 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpd52Q62393 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpd52Q62393 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpd52Q62393 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tpd52Q62393 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpd52Q62393 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpd52Q62393 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms