Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim28Q62318 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim28Q62318 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim28Q62318 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim28Q62318 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim28Q62318 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim28Q62318 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim28Q62318 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim28Q62318 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim28Q62318 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim28Q62318 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim28Q62318 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim28Q62318 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim28Q62318 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim28Q62318 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim28Q62318 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim28Q62318 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim28Q62318 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim28Q62318 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim28Q62318 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim28Q62318 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim28Q62318 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms