Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpcQ62241 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpcQ62241 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpcQ62241 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpcQ62241 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpcQ62241 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpcQ62241 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpcQ62241 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpcQ62241 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpcQ62241 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpcQ62241 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpcQ62241 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpcQ62241 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpcQ62241 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpcQ62241 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpcQ62241 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpcQ62241 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SnrpcQ62241 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SnrpcQ62241 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SnrpcQ62241 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SnrpcQ62241 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SnrpcQ62241 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SnrpcQ62241 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SnrpcQ62241 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SnrpcQ62241 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SnrpcQ62241 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms