Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sf3a2Q62203 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sf3a2Q62203 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms