Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sin3bQ62141 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms