Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phox2aQ62066 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2aQ62066 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms