Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pcbp2Q61990 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pcbp2Q61990 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pcbp2Q61990 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms