Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prg2Q61878 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prg2Q61878 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prg2Q61878 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms