Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga6Q61739 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga6Q61739 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga6Q61739 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms