Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AtrxQ61687 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AtrxQ61687 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AtrxQ61687 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AtrxQ61687 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms