Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gli3Q61602 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gli3Q61602 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms