Protein–RNA interactions for Protein: Q61526

Erbb3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb3Q61526 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Erbb3Q61526 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Erbb3Q61526 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Erbb3Q61526 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Erbb3Q61526 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Erbb3Q61526 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Erbb3Q61526 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms