Protein–RNA interactions for Protein: Q61414

Krt15, Keratin, type I cytoskeletal 15, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt15Q61414 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Krt15Q61414 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Krt15Q61414 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms