Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfap2bQ61313 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfap2bQ61313 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfap2bQ61313 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfap2bQ61313 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfap2bQ61313 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tfap2bQ61313 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tfap2bQ61313 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tfap2bQ61313 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tfap2bQ61313 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tfap2bQ61313 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tfap2bQ61313 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tfap2bQ61313 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tfap2bQ61313 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tfap2bQ61313 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tfap2bQ61313 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tfap2bQ61313 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tfap2bQ61313 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tfap2bQ61313 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tfap2bQ61313 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tfap2bQ61313 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tfap2bQ61313 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tfap2bQ61313 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tfap2bQ61313 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tfap2bQ61313 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms