Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Irf9Q61179 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf9Q61179 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irf9Q61179 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms