Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prpf4bQ61136 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf4bQ61136 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms