Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lamb3Q61087 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lamb3Q61087 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms