Protein–RNA interactions for Protein: Q61037

Tsc2, Tuberin, mousemouse

Predictions only

Length 1,814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc2Q61037 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tsc2Q61037 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsc2Q61037 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms