Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf3Q60980 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf3Q60980 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms