Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Laptm4aQ60961 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Laptm4aQ60961 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms