Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Grik1Q60934 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grik1Q60934 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms