Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cnot7Q60809 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnot7Q60809 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cnot7Q60809 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms