Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdkn2cQ60772 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdkn2cQ60772 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms