Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epha1Q60750 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epha1Q60750 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms