Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ItgaeQ60677 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ItgaeQ60677 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ItgaeQ60677 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ItgaeQ60677 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ItgaeQ60677 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ItgaeQ60677 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms