Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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PtprnQ60673 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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PtprnQ60673 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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PtprnQ60673 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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PtprnQ60673 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprnQ60673 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms