Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sik1Q60670 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sik1Q60670 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sik1Q60670 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms