Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Specc1Q5SXY1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Specc1Q5SXY1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Specc1Q5SXY1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms