Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Brip1Q5SXJ3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brip1Q5SXJ3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brip1Q5SXJ3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms