Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AbrQ5SSL4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AbrQ5SSL4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms