Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trdv4Q5R1A3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trdv4Q5R1A3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms