Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scarf1Q5ND28 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Scarf1Q5ND28 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms