Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm6bQ5NCY0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Kdm6bQ5NCY0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm6bQ5NCY0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm6bQ5NCY0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm6bQ5NCY0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm6bQ5NCY0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm6bQ5NCY0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm6bQ5NCY0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm6bQ5NCY0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm6bQ5NCY0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm6bQ5NCY0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm6bQ5NCY0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm6bQ5NCY0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm6bQ5NCY0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm6bQ5NCY0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms