Protein–RNA interactions for Protein: Q5M956

Kctd1, BTB/POZ domain-containing protein KCTD1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd1Q5M956 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kctd1Q5M956 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kctd1Q5M956 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kctd1Q5M956 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kctd1Q5M956 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kctd1Q5M956 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kctd1Q5M956 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kctd1Q5M956 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kctd1Q5M956 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kctd1Q5M956 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kctd1Q5M956 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kctd1Q5M956 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms