Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8N4

Sdr39u1, Epimerase family protein SDR39U1, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr39u1Q5M8N4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdr39u1Q5M8N4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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