Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q5EBG8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q5EBG8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q5EBG8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5EBG8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5EBG8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q5EBG8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q5EBG8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q5EBG8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q5EBG8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5EBG8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5EBG8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5EBG8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q5EBG8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms