Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam208bQ5DTT3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Fam208bQ5DTT3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Fam208bQ5DTT3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Fam208bQ5DTT3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Fam208bQ5DTT3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Fam208bQ5DTT3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Fam208bQ5DTT3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Fam208bQ5DTT3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Fam208bQ5DTT3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Fam208bQ5DTT3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam208bQ5DTT3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam208bQ5DTT3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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