Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Spag9Q58A65 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Spag9Q58A65 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms